来源：测序中国

由于肿瘤巨大的遗传多样性，开发癌症疫苗往往是一个令人望而生畏的课题。为了调查通用型癌症疫苗的可行性，罗氏制药的研究团队分析了63,000多个肿瘤的基因组谱，这项研究于2月24日在线发表在《Genome Medicine》期刊上。日前，这篇文章的第一作者、Foundation Medicine的研究员Ryan Hartmaier在其博客里对他们的发现进行了详细的解读。

肿瘤间的遗传多样性使通用型癌症疫苗的开发很困难

从根本上说，癌症是由基因突变驱动的基因疾病。确定特定癌症的基因组谱对寻找最有效的治疗方法是非常有效的。最近的研究进展表明，我们或可使用基因组信息来调节免疫系统以对抗癌症。

我们的免疫系统能够非常有效地识别和清除外来的病原体，如细菌和病毒。这种能力源于其将外源病原体蛋白片段区分为“异己”的能力。这些“异己”物质就是我们所谓的抗原。免疫系统能够调动各种攻击措施和防御能力来对付特定的病原体。通常情况下，我们可以使用疫苗来帮助免疫系统产生更强烈的反应。

与之相似的是，我们现在知道肿瘤内的突变可以被免疫系统识别。由于它们仅在癌细胞中被发现，因此被称为新抗原（neoantigens）。就像疫苗对传统病原体（如脊髓灰质炎和流感）有效一样，科学家们希望针对这些新抗原的疫苗能给癌症患者带来更多治疗的益处。

但是由于多种原因，设计和开发癌症疫苗往往令人望而生畏。癌症测序项目如癌症基因组图谱计划（TCGA）表明，肿瘤间具有巨大的遗传多样性。对于癌症疫苗开发，这意味着每个患者可能需要针对其肿瘤定制疫苗。这限制了这种方法的实用性，因为它要求的技术太高，难以规模化，并且对于主流来说，这样的疫苗过于昂贵。

通用型癌症疫苗只能使小于1%的癌症患者群体受益

为了分析肿瘤的遗传多样性和评估通用型癌症疫苗的可行性，研究者分析了超过63,000个肿瘤的基因组谱，它表明每个肿瘤通常包含一组独特的突变。

在这种广泛多样性的背景下，研究人员挑选出10种新抗原突变，并使更多的肿瘤（约25%）至少包含其中一个新抗原突变。这意味着，如果可以针对这10个突变（a poly-neo-epitope vaccine，多新表位疫苗）开发癌症疫苗，那么多达25%的癌症患者就可能又有了一种可行的治疗选择。

但我们知道，并不是所有的突变都能被免疫系统识别。因此，研究者应用最先进的算法，预测哪些突变可以被免疫系统识别。在最佳方案的分析中，研究表明通用型癌症疫苗的方法是可行的，但只有小于1%的癌症患者群体能受益。

这种分析提供了宝贵的数据来帮助指导癌症疫苗的开发工作，虽然仍具有某些局限性，但它提供了强有力的证据，表明癌症疫苗和其他靶向免疫疗法可能需要依赖于个体化的方法，来使绝大多数癌症患者受益。

参考文献：

Genomic analysis of 63,220 tumors revealsinsights into tumor uniqueness and targeted cancer immunotherapy strategies.DOI: 10.1186/s13073-017-0408-2