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序科码:创新三大单细胞平台,推动单细胞技术在生殖遗传和癌症诊疗领域率先落地

动脉网6阅读2021-11-11

单细胞技术的诞生开启了精准医疗新时代。


目前广泛应用的NGS技术,都是在大量细胞平均水平上对整个细胞群进行组学分析,无法反映细胞的异质性。单细胞测序是指单个细胞水平上,对基因组或转录组进行扩增并测序,以检测SNV、CNV、单细胞基因组结构变异、基因表达水平、基因融合、单细胞转录组的选择性剪切,以及单细胞表观基因组的DNA甲基化等表观修饰状态,从而识别细胞的类型、功能,特定细胞健康或状态的变化、变异,实现在单细胞水平对疾病和生物学过程中的遗传学特征进行研究。同时,单细胞测序技术的高敏感性也使得稀有细胞的高效和忠实检测成为可能。


细胞是生命体最小的单位,每个细胞都不一样,正如我们每个人都是千差万别的。传统的大样本多细胞测序实际上是对细胞群体的分析,这种群体研究会混淆我们对于细胞异质性的认识。


“好比我们想要调研居民的收入水平,此前,我们只知道每个村/小区的平均水平,并不知道到村/小区里每个人的情况。利用单细胞技术,不仅能够精准定位到每个细胞,还能在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观遗传组进行扩增和测序,研究在疾病的发生、发展、治疗等过程中存在的细胞间的高度异质性和克隆演变的特征,为实现疾病的精准诊疗带来了希望。”


“通过单细胞测序技术研究单个细胞基因组、转录组及表观遗传组学的特征,可用以监测血液肿瘤的进展、疗效、预后等,很可能发现潜在的治疗靶点,为疾病的精准诊断、动态监测及个体化治疗提供依据。更为重要的是,创新的单细胞技术有望在试管婴儿阶段以及妊娠早期的染色体病和基因病的筛查和诊断,通过提高效率和检测质量,把疾病的有效控制大大向前推了一步,对提高国人基因健康水平具有重大意义。”序科码生物医学研究院副院长张君孝博士告诉动脉网。


凭借着高敏感性及可解析细胞异质性等显著优势,单细胞测序技术在肿瘤防控、遗传健康、发育生物学、免疫和微生物学、神经科学等领域展现出了巨大的应用潜力,已经成为全球当之无愧的热门赛道。


序科码是国内少有的覆盖单细胞产业上、中及下游的企业,公司致力于将创新性的单细胞组学技术应用于科学研究、分子诊断、健康管理及药物开发等领域,特别是生殖遗传健康领域和癌症的精准诊疗。


公司目前拥有自主创新的核心技术平台MustSeq、mCNVS和mRRMS,以及国际前沿的10x GENOMICS、BD Rhapsody和Mission Bio Tapestri等六大技术平台,提供单细胞基因组、转录组、表观组、蛋白质组、多维组学和空间转录组等高通量测序的前沿技术服务。并基于自主创新的核心技术平台,进行临床应用的单细胞创新试剂盒和设备开发及相应生物信息学系统分析平台的创建和服务,助力精准医疗,造福人类健康。


国际单细胞技术先行者担任公司首席科学顾问


序科码创始团队在单细胞技术领域有多年经验,团队核心成员来自耶鲁大学和南方医科大学,其中不乏国际单细胞技术先行者。


联合创始人兼首席科学顾问Sherman M. Weissman是美国科学院院士、耶鲁大学Sterling终身讲座教授,不仅培养了多位美国科学院院士(如美国人类基因组计划负责人 Francis Collins)和一批常春藤盟校教授,也培养了一批世界500强公司高管,还成功创建了两家华尔街上市公司和三家成功转让的生物科技公司。全球首个也是目前应用最广泛的单细胞全基因组扩增技术和试剂REPLIg正是出自与他与David Wood院士共同创办的公司。


公司共同首席科学顾问潘星华教授是复旦大学遗传学博士、协和医学院和耶鲁大学双博士后、耶鲁大学研究员、南方医科大学生物化学与分子生物学系的主任、广东省单细胞技术与应用重点实验室主任。潘教授具有丰富的单细胞技术创新和临床应用方面的研发和管理经验,获得发明专利20余项,他主编的《Introduction to Single Cell Omics》英文专著2019年在欧洲发表,迄今获得全球读者超过24万人次。


2013年,单细胞技术被Nature Methods评为全球所有科技领域的年度技术,从而风靡一时,2019年、2020年单细胞多维组学技术和时空测序技术又分别被评为年度技术。目前,单细胞技术越来越多地被应用于科研领域,单细胞技术的临床应用前景也逐渐显现。2017年,序科码在广州科学城创立,由Sherman M. Weissman教授和潘星华教授担任首席顾问科学家。


序科码是国内率先引进10X Genomics单细胞测序设备的企业,成立之初主要开展10X Genomics单细胞测序技术服务。2019年,序科码引进了BD的单细胞测序平台,此后又引进了Mission Bio的技术平台,进一步扩大了其在科研市场的单细胞测序服务规模。


此外,序科码研发团队基于其在单细胞技术领域多年的沉淀,聚焦单细胞测序技术创新和临床应用产品开发。现在,序科码已经成为国内少有的覆盖单细胞产业上、中及下游链条的优秀国家级高新技术企业。


三大单细胞测序创新技术,覆盖产业上中下游链条


据张君孝博士介绍,单细胞产业上游为单细胞分选、建库设备和试剂开发,中游是基于商业化平台,提供单细胞测序服务,下游则是基于商业化或自主创新技术平台,开发临床应用终端产品。


在上游,我国单细胞分析平台以10X Genomics和BD等国外企业的产品为主。2018年左右,国内诞生了多家专注上游分析平台开发的企业,但多数处于“me too”或“fast follow”阶段,仅有少数企业实现了二次创新,且大多集中在转录组。


序科码致力于实现单细胞产业上游技术平台的创新,自主研发了单细胞拷贝数变异技术(mCNVS)和单细胞甲基化测序技术(mRRMS)


公司研发的单细胞拷贝数变异技术可实现一系列单细胞的从头混合建库,在早期就进行可溯源性标记各单个细胞以备测序后精准解码,同时采用一步法取代了多步法建库,有力降低了建库时间和成本,提高了效率和质量。单细胞甲基化测序技术可实现批量单细胞合并建库,实现中高通量,提高效率。


在中游,序科码依托自主创新的mCNVS、mRRMS和致力于临床应用型中通量RNA测序的MustSeq三大技术平台,以及10x Genomics、BD Rhapsody和Mission Bio Tapestri等国际前沿平台,可为科研机构、医院、药企研发中心等客户提供单细胞基因组、转录组、表观组、蛋白质组、多维组学和空间转录组等高通量测序的前沿技术服务。


最近,序科码单细胞组学创新技术项目入选国家多部委联合主办的“2021中关村论坛”评选的《百项国际技术交易创新项目榜单》。


目前,序科码已经为国内外多所高校或科研机构提供了测序服务,其自主研发的三项创新技术相关试剂盒已经完成小试,正处于中试阶段,预计今年年底将进入市场。为科研市场提供服务的同时,公司搭建了单细胞数据库和细胞库,为药企提供服务。


在下游,序科码将创新性的单细胞组学技术应用于生殖遗传健康癌症精准诊疗等终端场景。


“随着三孩政策放开,不孕不育发病率提高,辅助生殖市场不断扩大。序科码研发的单细胞拷贝数变异技术非常适用于生殖遗传健康领域,可用于胚胎植入前遗传学诊断/筛查和无创产前DNA检测,高效、精准对早期胚胎进行染色体数目和结构异常的检测及与拷贝数变异相关的遗传疾病,预防出生缺陷。同时我们也在开发肿瘤精准诊断产品,如肿瘤早筛、肿瘤复发预后等。”张君孝博士表示。


目前,序科码已经和南方地区多个医院的生殖中心合作进行单细胞拷贝数变异技术的临床应用。此外,公司正在建立第三方医学检验所和GMP生产场地,即将启动基于单细胞拷贝数变异技术平台的的胚胎植入前遗传学诊断/筛查试剂盒的申报,进军生殖遗传临床市场。


张君孝博士谈到:“单细胞技术在临床市场正处于萌芽期。但我们认为,单细胞技术在辅助生殖领域已经相当成熟,将首先在该领域实现临床落地。


基于其原始创新优势,未来序科码将持续巩固在上游单细胞测序建库上的技术优势,加强中游单细胞测序服务和生物信息服务,降低单细胞测序成本,提高效率,推动单细胞技术在下游遗传生殖和肿瘤领域临床终端应用,致力于建设成为单细胞临床应用的开拓性和龙头企业。

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